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| Accession Number |
TCMCG016R21197 |
| RNA Id |
AWWV01012808.1_mrna_21197 |
| Length |
5382bp |
| Locus_tag |
CCACVL1_21769 |
| db_xref |
InterPro:IPR000477 |
| Organism |
Corchorus capsularis |
| Molecule_type |
mRNA |
| Product |
reverse transcriptase |
| Location |
complement(join(8054..8507,8920..8997,9175..9293,9399..10984,11111..11431,11557..12546,14548..16381)) |
Sequence:
ATGACTCCCATCTTTACCACTCCTAAAACCAGCAATATGGACAACATGGTCATGGACCAGACATGCAGCAATCCATGTTGTTTCTTTTGCATCATGAAAGAGCCAGACCAATCTCTCAGAAGAGCAGGAATAGCAAGCTGTTTCAAAGAAATGCCTCTCAATGGAGATGACCAAGAACATGTTTTGGTTCTGAGTGGTCTCTGGAACATTGCCATGACTCAACCAGATGACCCAGAGTTCCCTTCCCTTGGCATCTTTGATTGCATGGCAAGTTTCATAGAGAAAGGAGTCAATGACAGAAGCTGGCTTCTCAGAGATCAGAACATTTACATACCTTACTATGCTGCTCATGTCATCGGTTCTTACACTATGAACAAGGTTGAGTTTGCAGAGAAAGCTGTCCTTGCAGGTGTGATACCTCCATTAATGGAGCTTCTAAGGGGAAAGATAAGTTGGGTTGAGCAACGAGTTGCGGTCCGAGCCCTCGGTCACCTGGCAAGCTATGAGAGAACGTTTGAAGCATTAGCAACATATGAAGAGGAAGTGGTAAGGTTAGGAATGCACTTAGCTTCTACTTGCCTTAATGAAGTGTATGTTAAATTTGTAGGTGTTAAAGATAAGAGTAAGAGATCAACATATCACTGTGATTTGCTTACAAGAGGAGTTGGTGGTTCAGAAATGGAGAACAGAAAGGCTGAAGAATGGGCTAGCCAGCTTCAATGCTGGTCTCTTTATCTTCTCAATTGCTTTGCTTACAAGGAAAGATCTCTGAATCTTATTTGTAAGCAAGAGTTTTTGACAGATTTGTCTAAAATGTGGGGTGGATTAGTGAATCATTCATCACCAGCTGGAGTGGGACTGATAAGAATCTTGTGTTATAGTAAGTATGGAAGAAAAAACATCTCTGAATGTAAGGAAGTCTTAGAAAATCTATGTCATCTCTCGAGATCATCAGATGATTGGCAATACATGGGGATTGATTGTCTTCTATTGCTGCTCAAAGACCCAGATACGAGGTACAAGGTTATGGAAATTGCCACCATGTTTCTTATTGATTTGGTTGAACTCAAAAGCCTTGGAGACAGATCAGGGTTAGGTGAAACAATCACAAAAGCCCTCCTCTTAGATTATAAACAAAGCAAAATCAGAATCAAGAACACCCATGTTCAAAAGGCATTAAAGGAAACATGGGAGTTAAAGGTAGAAAGGCGAAAGAGAGAAAAGATGATTTCTGATGAAAAAGTTGAAGAAAGAAGAGTCCTAGCAAACCTGATAAAGCAACAAGCAAACCATTTGTTCTGGTTAGGAGATGTCGAAGCTGCTGTAAAAAGCTTCACGGAAGCATTAAATGCATGCCCTTTGAAGCATAGAAAAGATAGAATGATTCTCTATAGTAATAGAGCTCAGTGTTATTTGCTACTAAGAAACCCTGATGCTGCCATTAGAGACTCAACTCGAGCTCTTTGCCTCTCCAATCCTGCAAATTCTCATGGTAAGAGTTTGTGGAGAAGATCACAGGCTTATGACATGAAAGGGTTGGCTAAAGAGAGCTTGATGGACTGTATAATGTTCATCAATGGCTGCATCAACTCAGAGAAGAAGACTAACAAGCGTGTCAAGATTCCATACTATGCAGCTCGTATGATCAGCAAACAGATGGATGCCACATGGCTGTTTGCCAATGCTCAGTCCAAGGCCACAAGCAATGATCATCTGAGAAAAGTACAAGAATCAGACGATGATTATGAGATAAACAGCAATGAAGATCAAGATGATGATCAGTGTATTGATGAAATTATGAGGATGATGATGGAGAAGAAAAGTATAGCATCTGAGTTCATCACACCATCGAAAACAGAGGATAAGGTCAGAAGAGCTCCTGAAGACATCTATGAAGATGTAGCAAAGGAATGGAAAAATTGTCTAGTACTGCAATTTTTGGGGAAAGTCCCGAATCTCAGCCAGATTCACCGCATTCTAAACAATATTTGGGGGCGTGATGGGCAAGTACGAATCACTTCCACAGATTACGACTTGTTTATCATTCATCTTCCAACAGAAAGCACTCGACAGTGGATACTAGAGTCAGGTCCTTGGCATGTGATGAATCAGCCAGTGGTGGTACGTCAATGGGAGCCCGGAGTCACAAAGCTTGACATTGATCTCACCAAATTTCCAGTTTGGGTGAACTTGAAGGGGGTGCCGCTTGAGCTCTACACCAAAAGAGGCCTTAGCTTCATAGCCAGTGGTATAGGTATGCCCTTATACATGGATAAAGCTACTGCATATAAACAAAGTTTACACACCGCTAAAGTTTGTATTGAAGTTGATTTCTCTATTGATATACCTGATCATCTAGAAGTTGAGATGAAAAATGGATACGTAGTTAAAATTGGCATAGATATACCCTGGAAACCCCCTAAATGTCCAAAATGCAAAGTCTTTGGGCATTCAGATTGTTCTAAAAAGCACTCGGAGAAGATCTGGATGCCAAAAGAATCAAAATCTGTGCACATTGTAGATAACTCTGTCAATGAACCAGTTTTGCCTGTTGAGATACCTATTTTGCATTTAGATGAAACTATTGTTGAGTCTGAATTAGAATTTGAGCCAAATTTGCAGTCAAGTGCTCAATTTCCACCTCTCACAGTAGATAAGTCTGCAGACAAAGGGAAAATGGTGCAAGGCTCTTCTGCATCTGGTAATAGATTTGCTATCTTAGACACTGCGACAGTTGAAGTTACTGGAAGTAGTGTTAATACAACCATTGCTTCAGTTGAGAAAAGTCCCCCAAAAAAGAGAGCAGAAAGGGCAGCTTCAGCTTCTGTTTGGAATGTAAGAGGCTTTAATGACCTCTCCAAACAAGCTGAAAAGGTGAAAAGAATAAGATCTCTTAATGCAGATATTGTGTGCTTGCTAGAGACTAGAGTCAAGTTCCCCAAATTTGATAAGATTGTAGATAAGCATTTTCAAGATTTCAATTGTTTGCATAACTATAGCCATGCTACAAATGGAAGAATCTGGGTTTTATGGAAATCTGATATTCAATTAGATCATGTCATCACTACAGAGCAGAGTATCACTGTTAAGGTTGTTTCCGCTCAACAATCTTTCTTTCTAACAGCTTCATATGGAGCTAACAAAGGTATTACCTCTGATATTGTTGAGTTTAATGAATGCTTGAATGACATATCTGTTTTTGATCATTCTTACACTGGCCCTATATTCACTTGGTATAATAACAATGATGAGCACCCTTTATCACGGAAACTAGATAGAGTTTTAATTAATGCTGAGTGGCTGCAATGTTTTGCTGACTCTATGGTTGAATTCATGTTGCCTGATGTTTCTGACCATTGTCTTATGTTTATAAGAACTGATGTGAAGTTTTTCTCTCCTCCAAAGCCTTTTAAGTTCTTCAATTACTGGACCAAACACGCTGAATTTTTACAACTTATAAATGATGTTTGGAGTGGAAATGTAACTGGGAATCGAATGCAAAGATTAAGTAAAAAGTTTAAGTCTCTTAAATCAGTTTTAAAGGAATTCAACAGAAAACATTTTGGTAATCTACCACAGAAGGTAGTTGAGAAAAAGGCTGAGATTGCTACACTTCAGAAGGGTATTCTCGTATCCCCTGCTGCAGACTTAATTCAAAGACACAAAATTGCTACAAATGAACTTCATGAGCTGCAATTAGCAGAAGAAAGCTTTTATAAGCAGAAATCTAGAGTACAATGGTTGCAAGAAGGAGATTTAAACACAGGGTTTTTTCATAAGACTATGAAGATCAGGAATAAAAGGAACGATATTAGACTGTTATATAAAGAGAATGGGGACAGACTTCACACTTATGCAGAAATTCGAGATGAAGCTGTCAACTATTATCAGAATTTTCTTGGCAAAAAGGATGACAATATCTCTAGTTGCCCTGCAGATCTTCTACAGGACATTCTTCAAAATTCTATCTCAGAGGAGTTGGCTAGAAAAATCATAGAACCTGTTACTGAGGAGGAGATTAGAGCTACTTTTTTCAGTCTCAATAGCAACAAAGCTTCTAGTCCAGATGGTTACTCAGCACATTTCTTCAAGGCAGCATGGAGTATTGTGGGTAAAGATGTGATTACTGCTATTCTTTATTTCTTTGAATCTTCTAGAATTTCTCCTGGTATTAATTCTACCGTAATTGCTTTGGTTCCAAAAGTTGATAACCCTAGTCATATGACTGATTTTAGACCTATATCCTGTTGCACTATGATCTATAAGTGCATTGCTAAAATTTTAGCTAATAGACTTAAACAATGTCTCCCTGGGTTAATTTCTATAAAACAAAGTGCTTTCATTGAGGGGAGGAGTATAATAGACAATGTTCTTATGGCTCAAGAGCTTGTGAGTAGATATAATAAATCTCAATTATCTCCTAGATGTGCTATTAAGATAGACCTTCGAAAAGCTTTTGATACTCTTGATTGGGGTTTTATTTTGAATATATTTAAGGCTTTAAATTTCCCTAAACAGTTTGTGAATTGGATTTCTACTTGTATCACTACTACTAGATTCTCTGTCTCCATTAATGGTGGTTTAGAGGGTTATTTTACAGGAGCAAGGGGAGTAAGGCAGGGAGACCCTCTCTCCCCTTATATTTTTGTTATGGCTATGAATACCTTGTCTAAGCTGCTGGATTATGGAGTAGATCATGGTGTTTTTGGTTTCCACCCAAAGTGTAAAAAGTATTCAGGCTTTTGTATGAATTGTTCAAAGAGTGAAATATTCTATACTGGTATATACGATGAGTGTATGGTAGAAATTCAGGTAGAAACTGGTTTTAAAGTTGGGGATTTACCAGTCAGGCAGTTGTGGATAAAGTTTGTCAGCTTTGTGCAAGCTATTTATGGAAAGGGAAGGAAGGTAATAGTCGAGGAGCAAAGATTGCCTACCCGGGAGAGACTTGCACAATGGGGCTTGAAATTGGATTCTACAGCTTGTTTACTTTGTGGTCA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